doi: 10.1101/2024.06.09.598160
초록
암의 발생과 진행에서 마이크로바이옴의 역할이 점점 더 중요하게 다뤄지고 있습니다. 종양 미세환경 내 마이크로바이옴 조절 메커니즘을 탐구하고 그 구성·기능을 이해하는 것이 핵심 과제로 부상하고 있으며, 공간 전사체의 도입은 마이크로바이옴이 종양 미세환경에 어떻게 영향을 미치는지 새로운 관점에서 들여다볼 수 있게 합니다.
본 연구에서는 구강 편평세포암, 두경부암, 대장암 샘플에서 미매핑 RNA 리드를 PathSeq와 자체 확장 기법으로 처리해 미생물 RNA의 공간 분포를 분석했습니다. 종-특이적인 미생물 16S rRNA 서열을 포함하는 맞춤형 레퍼런스를 활용해 종 수준의 분류 정확도를 높였습니다.
연구 결과는 암 조직 내 미생물 분포와 기능적 역할에 대한 더 깊은 이해 가능성을 보여줍니다. 이 발견은 암 연구에서 마이크로바이옴의 역할을 재조명하며, 향후 마이크로바이옴 기반 치료제 개발의 토대가 됩니다.
저자: Park SH, Park J, Kim J, Choi H, Kim IG, Chung E-J, Na KJ (2024)
