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AI / ML

공간 전사체 모델 벤치마킹 — 무엇을, 왜 측정하는가

공개 벤치마크는 잘 정제된 몇 개 조직에 과도하게 편향돼 있습니다. VGL과 PortraiTME™를 정직하게 유지하기 위해 포트래이가 사내에서 운영하는 평가 스위트를 공유합니다.

HC
최홍윤 2026년 4월 15일 - 9분 읽기
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암종별 벤치마크 막대그래프
암종별 벤치마크 막대그래프

공개 벤치마크의 커버리지 문제

공간 전사체 모델의 공개 벤치마크 대다수는 폐·유방·대장에 과도하게 쏠려 있습니다 — 큐레이션된 데이터가 가장 많은 암종들이죠. 이런 벤치마크에서 좋은 점수를 받는 모델이 BD 파트너가 실제로 묻는 다른 암종에서는 무너지는 일이 흔합니다.

사내 평가 스위트

모델 릴리스마다 직교한 세 가지 지표를 추적합니다:

  1. 7개 암종 세포타입 AUROC — NSCLC · SCLC · BRCA · COAD · PRAD · RCC · ESCA
  2. 코호트 간 강건성 — 샘플 단위가 아니라 환자 코호트 전체를 hold-out 했을 때의 점수 분산
  3. OOD 검출 — 학습에 없던 희귀 암종에서의 flagging 정확도

PortraiTME™는 현재 NSCLC 상피세포에서 0.96, hold-out 세트에서 가장 거리가 먼 암종에서 0.88의 AUROC를 기록합니다.

앞으로

공개 벤치마크는 결국 따라옵니다. 그때까지는 사내 벤치마크가 BD 파트너에게 정직한 모델 의사결정을 제공하는 유일한 방법입니다.

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